Le syndicat est composé de 10 communes
Les communes adhérentes, fondatrices du Syndicat des Eaux de Froidefontaine sont Belleherbe, Chamesey, Charmoille, Froidevaux, La Grange, Les Terres de Chaux, Provenchère, Surmont et Vaucluse.
En 2004, la commune de Bretonvillers adhère au syndicat.
En 2005, la commune de Longevelle lès Russey adhère au syndicat.
De 2006 à 2017, le Syndicat des Eaux de Froidefontaine est composé de 11 communes.
Au 1er janvier 2018, les communes des Terres de Chaux et de Vaucluse quittent le syndicat puisque la compétence eau a été transféré à la Communauté de Communes du Pays de Maîche (Loi NOTRe).
Suite au retrait des communes de Terres de Chaux et Vaucluse, le syndicat a signé une convention de fourniture d'eau potable avec la Communauté de Communes du Pays de Maîche.
Au 1er janvier 2019, la commune de Belvoir adhère au syndicat.
